测序仪型号(illumina测序仪型号)
测序仪中标
展开全部现在的话平台首选是illumina的,但是如果说到型号的话要看你需要的读长和样本量
测序仪的用途
测序仪市场在用的,到第三代测序仪。
第一个测序实验是Sanger于1960s进行,于1976年正式出现第一台商用测序仪。为第一代测序仪;
国内外主流测序仪主要有以下几种:
第一代测序仪:ABI的3730XL型号测序仪,测序原理是sanger法测序;
第二代测序仪:illumina的MiSeq、NextSeq、HiSeq等系列型号测序仪;iontorrent的ionProton测序仪;ABI的SOLID测序仪(已不在中国供货);罗氏的454测序仪(已于2013年底停产);
第三代测序仪:CG公司的CG测序系统(2013年被华大基因收购,有人认为CG不属于第三代测序仪);太平洋生物公司的PacBioRSII测序仪等。
illumina测序仪型号
搜一下:DNA测序仪已发展到第几代了?什么时候人们才开始关注DNA测序的?国内外的DNA测序仪发展的现状?
3100测序仪
01基因测序仪
·型号:Nextseq™ 550Dx
·品牌:illumina
·购置时间:2021年6月
·仪器状态:全新
·其他:有注册证
02基因测序仪
·型号:Nextseq 500
·品牌:illumina
·购置时间:2021年10月
·仪器状态:状态良好,正常使用
·其他:无注册证
03基因测序仪
·型号:NextseqCN500
·品牌:贝瑞和康
·购置时间:2021年3月
·仪器状态:状态良好;正常使用
·其他:有注册证
04联系方式
不走弯路
直接callme
彭女士 18667191003
测序仪器价格
这是我在网上找来的,自己感觉说的挺全的,你看看。不过我要说一句,目前DNA测序所依靠的还是Sanger的原理,只是结合了荧光染料,提高了灵敏度。DNA测序原理和方法DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PEABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABIPRISM310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。【原理】ABIPRISM310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3''末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupleddevice)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA测序胶(POP6)和GeneScan胶(POP4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。电脑中则包括资料收集,分析和仪器运行等软件。它使用最新的CCD摄影机检测器,使DNA测序缩短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析为10~40min。由于该仪器具有DNA测序,PCR片段大小分析和定量分析等功能,因此可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析(SSCP)、微卫星序列分析、长片段PCR、RT-PCR(定量PCR)等分析,临床上可除进行常规DNA测序外,还可进行单核苷酸多态性(SNP)分析、基因突变检测、HLA配型、法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定等。【试剂与器材】1.BigDye测序反应试剂盒主要试剂是BigDyeMix,内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaqDNApolymeraseFS,反应缓冲液等。2.pGEM-3Zf(+)双链DNA对照模板0.2g/L,试剂盒配套试剂。3.M13(-21)引物TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2μmol/L,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。4.DNA测序模板可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA,浓度为0.2g/L,即200ng/μl。5.引物需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/L,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如M13(-21)引物,T7引物等。6.灭菌去离子水或三蒸水。7.0.2ml或和0.5ml的PCR管盖体分离,PE公司产品。8.3mol/L醋酸钠(pH5.2)称取40.8gNaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调pH至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。9.70%乙醇和无水乙醇。10.NaAc/乙醇混合液取37.5ml无水乙醇和2.5ml3mol/LNaAc混匀,室温可保存1年。11.POP6测序胶ABI产品。12.模板抑制试剂(TSR)ABI产品。13.10×电泳缓冲液ABI产品。14.ABIPRISM310型全自动DNA测序仪。15.2400型或9600型PCR仪。16.台式冷冻高速离心机。17.台式高速离心机或袖珍离心机。【操作步骤】1.PCR测序反应(1)取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:所加试剂测定模板管标准对照管BigDyeMix1μl1μl待测的质粒DNA1μl-pGEM-3Zf(+)双链DNA-1μl待测DNA的正向引物1μl-M13(-21)引物-1μl灭菌去离子水2μl2μl总反应体积5μl,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧PCR管,用手指弹管混匀,稍离心。(2)将PCR管置于9600或2400型PCR仪上进行扩增。98℃变性2min后进行PCR循环,PCR循环参数为96℃10s,50℃5s,60℃4min,25个循环,扩增结束后设置4℃保温。2.醋酸钠/乙醇法纯化PCR产物(1)将混合物离心,将扩增产物转移到1.5mlEP管中。(2)加入25μl醋酸钠/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀DNA。12000r/min于4℃离心30min,小心弃上清。(3)加70%(V/V)的乙醇50μl洗涤沉淀2次。12000r/min于4℃离心5min,小心弃上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10~15min。3.电泳前测序PCR产物的处理。(1)加入12μl的TSR于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解DNA沉淀,稍离心。(2)将溶液转移至盖体分离的0.2mlPCR管中,稍离心。(3)在PCR仪上进行热变性(95℃2min),冰中骤冷,待上机。4.上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管,1.2kV预电泳5min,按编程次序自动进样,再预电泳(1.2kV,20min),在7.5kV下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗,灌胶,进下一样品,预电泳和电泳。每一个样品电泳总时间为2.5h。电泳结束后仪器会自动分析或打印出彩色测序图谱。5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。【计算】测序反应精确度计算公式:100%-差异碱基数(不包括N数)/650×100%差异碱基即测定的DNA序列与已知标准DNA序列比较不同的碱基,N为仪器不能辨读的碱基。【注意事项与评价】1.ABIPRISM310基因分析仪是高档精密仪器,需专人操作、管理和维护。2.本实验测序PCR反应的总体积是5μl,而且未加矿物油覆盖,所以PCR管盖的密封性很重要,除加完试剂后盖紧PCR管盖外,最好选用PE公司的PCR管。如PCR结束后PCR液小于4~4.5μl,则此PCR反应可能失败,不必进行纯化和上样。3.作为测序用户来说,只需提供纯化好的DNA样品和引物,一个测序PCR反应使用的模板不同,需要的DNA量也就不同,PCR测序所需模板的量较少,一般PCR产物需30~90ng,单链DNA需50~100ng,双链DNA需200~500ng,DNA的纯度一般是A260nm/A280nm为1.6~2.0,最好用去离子水或三蒸水溶解DNA,不用TE缓冲液溶解。引物用去离子水或三蒸水配成3.2pmol/μl较好。4.本实验使用的测序试剂盒是BigDye荧光标记终止底物循环测序试剂盒,一般可测DNA长度为650bp左右。本仪器DNA测序精确度为(98.5±0.5)%,仪器不能辨读的碱基N<2%,所需测定的长度超过了650bp,则需设计另外的引物。为保证测序更为准确,可设计反向引物对同一模板进行测序,相互印证。对于N碱基可进行人工核对,有时可以辨读出来。为提高测序的精确度,根据星号提示位置,可人工分析该处彩色图谱,对该处碱基作进一步核对。
测序仪参数
这是我在网上找来的,自己感觉说的挺全的,你看看。
不过我要说一句,目前DNA测序所依靠的还是Sanger的原理,只是结合了荧光染料,提高了灵敏度。
DNA测序原理和方法
DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PEABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABIPRISM310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。
【原理】ABIPRISM310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3''末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupleddevice)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。
它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA测序胶(POP6)和GeneScan胶(POP4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。电脑中则包括资料收集,分析和仪器运行等软件。它使用最新的CCD摄影机检测器,使DNA测序缩短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析为10~40min。
由于该仪器具有DNA测序,PCR片段大小分析和定量分析等功能,因此可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析(SSCP)、微卫星序列分析、长片段PCR、RT-PCR(定量PCR)等分析,临床上可除进行常规DNA测序外,还可进行单核苷酸多态性(SNP)分析、基因突变检测、HLA配型、法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定等。
【试剂与器材】
1.BigDye测序反应试剂盒主要试剂是BigDyeMix,内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaqDNApolymeraseFS,反应缓冲液等。
2.pGEM-3Zf(+)双链DNA对照模板0.2g/L,试剂盒配套试剂。
3.M13(-21)引物TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2μmol/L,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。
4.DNA测序模板可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA,浓度为0.2g/L,即200ng/μl。
5.引物需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/L,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如M13(-21)引物,T7引物等。
6.灭菌去离子水或三蒸水。
7.0.2ml或和0.5ml的PCR管盖体分离,PE公司产品。
8.3mol/L醋酸钠(pH5.2)称取40.8gNaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调pH至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。
9.70%乙醇和无水乙醇。
10.NaAc/乙醇混合液取37.5ml无水乙醇和2.5ml3mol/LNaAc混匀,室温可保存1年。
11.POP6测序胶ABI产品。
12.模板抑制试剂(TSR)ABI产品。
13.10×电泳缓冲液ABI产品。
14.ABIPRISM310型全自动DNA测序仪。
15.2400型或9600型PCR仪。
16.台式冷冻高速离心机。
17.台式高速离心机或袖珍离心机。
【操作步骤】
1.PCR测序反应
(1)取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:
所加试剂测定模板管标准对照管
BigDyeMix1μl1μl
待测的质粒DNA1μl-
pGEM-3Zf(+)双链DNA-1μl
待测DNA的正向引物1μl-
M13(-21)引物-1μl
灭菌去离子水2μl2μl
总反应体积5μl,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧PCR管,用手指弹管混匀,稍离心。
(2)将PCR管置于9600或2400型PCR仪上进行扩增。98℃变性2min后进行PCR循环,PCR循环参数为96℃10s,50℃5s,60℃4min,25个循环,扩增结束后设置4℃保温。
2.醋酸钠/乙醇法纯化PCR产物
(1)将混合物离心,将扩增产物转移到1.5mlEP管中。
(2)加入25μl醋酸钠/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀DNA。12000r/min于4℃离心30min,小心弃上清。
(3)加70%(V/V)的乙醇50μl洗涤沉淀2次。12000r/min于4℃离心5min,小心弃上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10~15min。
3.电泳前测序PCR产物的处理。
(1)加入12μl的TSR于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解DNA沉淀,稍离心。
(2)将溶液转移至盖体分离的0.2mlPCR管中,稍离心。
(3)在PCR仪上进行热变性(95℃2min),冰中骤冷,待上机。
4.上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管,1.2kV预电泳5min,按编程次序自动进样,再预电泳(1.2kV,20min),在7.5kV下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗,灌胶,进下一样品,预电泳和电泳。每一个样品电泳总时间为2.5h。电泳结束后仪器会自动分析或打印出彩色测序图谱。
5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。
6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。
【计算】
测序反应精确度计算公式:100%-差异碱基数(不包括N数)/650×100%
差异碱基即测定的DNA序列与已知标准DNA序列比较不同的碱基,N为仪器不能辨读的碱基。
【注意事项与评价】
1.ABIPRISM310基因分析仪是高档精密仪器,需专人操作、管理和维护。
2.本实验测序PCR反应的总体积是5μl,而且未加矿物油覆盖,所以PCR管盖的密封性很重要,除加完试剂后盖紧PCR管盖外,最好选用PE公司的PCR管。如PCR结束后PCR液小于4~4.5μl,则此PCR反应可能失败,不必进行纯化和上样。
3.作为测序用户来说,只需提供纯化好的DNA样品和引物,一个测序PCR反应使用的模板不同,需要的DNA量也就不同,PCR测序所需模板的量较少,一般PCR产物需30~90ng,单链DNA需50~100ng,双链DNA需200~500ng,DNA的纯度一般是A260nm/A280nm为1.6~2.0,最好用去离子水或三蒸水溶解DNA,不用TE缓冲液溶解。引物用去离子水或三蒸水配成3.2pmol/μl较好。
4.本实验使用的测序试剂盒是BigDye荧光标记终止底物循环测序试剂盒,一般可测DNA长度为650bp左右。本仪器DNA测序精确度为(98.5±0.5)%,仪器不能辨读的碱基N<2%,所需测定的长度超过了650bp,则需设计另外的引物。为保证测序更为准确,可设计反向引物对同一模板进行测序,相互印证。对于N碱基可进行人工核对,有时可以辨读出来。为提高测序的精确度,根据星号提示位置,可人工分析该处彩色图谱,对该处碱基作进一步核对。
测序仪品牌对比
AB和SCIEX是两个不同的品牌和公司,它们分别提供科学仪器和设备。下面是它们之间的一些区别:
1. 公司背景:AB(Applied Biosystems)是一家生命科学领域的公司,专注于提供基因测序、PCR、基因表达分析等相关仪器和试剂。而SCIEX是一家专注于质谱仪器和相关科研解决方案的公司。
2. 产品领域:AB主要关注生命科学和基因领域的仪器和试剂,如基因测序仪、实时荧光PCR仪等。SCIEX主要关注质谱仪器,包括质谱分析和质谱成像等领域。
3. 技术特点:AB和SCIEX在仪器性能和技术创新方面有一定的区别。每个公司都有自己的技术专长和产品线,以满足不同领域的科研需求。
总的来说,AB和SCIEX是两个不同的公司,在不同的科学仪器领域有各自的专长和产品线。您可以根据具体的研究需求和应用场景,选择适合的产品品牌和型号。
测序仪使用说明
来源:精准家
01基因测序仪
·型号:Nextseq™ 550Dx
·品牌:illumina
·购置时间:2021年6月
·仪器状态:全新
·其他:有注册证
02基因测序仪
·型号:Nextseq 500
·品牌:illumina
·购置时间:2021年10月
·仪器状态:状态良好,正常使用
·其他:无注册证
03基因测序仪
·型号:NextseqCN500
·品牌:贝瑞和康
·购置时间:2021年3月
·仪器状态:状态良好;正常使用
·其他:有注册证
04联系方式
不走弯路
直接callme
彭女士 18667191003
——
体外诊断新媒体&服务平台
满足好奇丨解决问题
长按加入IVD通讯录
融入圈子,扩充人脉
添加好友,邀您进群
热线:4008-0571-82
邮箱:service@iivd.net
本站转载文章观点仅代表原作者,如有侵权请联系删除!
点“在看”给我一朵小桔花
测序仪q30
现在的话平台首选是illumina的,但是如果说到型号的话要看你需要的读长和样本量
下一篇:没有了